维度裂隙闭合后的第三年，宇宙各处仍残留着不安的震颤。世界树根系末端的星域里，时不时会出现紫色的能量残影，如同伤口愈合后的疤痕，隐隐作痛。零的万象中枢持续处于高度警戒状态，量子沙盘上布满闪烁的红点，标记着那些尚未完全净化的维度残留能量。
莱娅在世界树的「音律摇篮」中沉睡，她的身体被发光的琴弦缠绕，构成茧状的保护屏障。每当世界树的树冠被微风吹拂，那些琴弦便会自动震颤，奏出空灵而哀伤的曲调。音律之城的居民们聚集在摇篮下方，聆听着这些无意识的旋律，试图从中解读出守护女神的讯息。年轻的音律学徒艾莉丝尤其痴迷于此，她每日都会带着竖琴前来，尝试模仿这些神秘音符，却总是在某个节点出现刺耳的杂音。
维蕾娜在光暗骑士团的基地中休养，她的战甲被维度黏液腐蚀的孔洞仍未完全修复，每一处裂痕都闪烁着诡异的紫光。团内最年轻的骑士凯洛斯每天都会为她送来特制的能量药剂，同时带来宇宙各处的情报。“青铜星云出现了记忆紊乱的现象，居民们开始混淆现实与梦境。”凯洛斯汇报时，维蕾娜的瞳孔微微收缩——记忆问题向来是露娜的专长，可如今露娜仍在深度昏迷中，躺在记忆仲裁者总部的「永恒梦境舱」里。
露娜的意识被困在记忆之海的深处，周围漂浮着无数破碎的记忆泡泡。这些泡泡里不再是守望者们的英勇时刻，而是充斥着黑袍人扭曲的面孔、维度裂隙中伸出的触手，以及世界树枯萎的画面。她的永恒之剑黯淡无光，插在记忆沙滩上，镜面蒙着一层紫色雾气。记忆仲裁者们日夜守在舱室外，不断将纯净的记忆能量注入舱内，试图唤醒他们的领袖，却收效甚微。
零在万象中枢的核心实验室里，正专注地培育着三颗新的火种。暗金色的培育舱中，音律火种呈现出水晶琴键的形态，表面流转着彩虹色的光晕；光暗火种如同阴阳鱼般缓缓旋转，光与暗的能量在其中达成微妙平衡；记忆火种则是一团不断变幻的金色云雾，隐约能看到各种记忆场景在其中闪现。“你们将成为新宇宙的免疫系统。”零轻声说道，机械手指在控制面板上飞速敲击，为火种注入最后的防护程序。
然而，平静的表象下暗流涌动。在宇宙边缘的「寂静星域」，一艘由维度金属打造的黑色方舟正在悄然成型。方舟表面布满与裂隙黏液相同的纹路，船头雕刻着巨大的眼睛，瞳孔中闪烁着对生命的漠视。方舟内部，被同化的黑袍人们正在进行某种邪恶仪式，他们将捕获的小型星系作为祭品，投入巨大的熔炉中，熔炉中沸腾的紫色液体，正是维度噬元兽的本源物质。
艾莉丝在一次尝试模仿莱娅的音律时，琴弦突然迸发出强烈的光芒，将她卷入一个神秘空间。在那里，她见到了沉睡的莱娅意识投影。“孩子，你听到了裂隙的残响...”莱娅的声音虚弱却坚定，“那些杂音不是错误，而是指引。找到音律与维度频率的共鸣点，才能阻止它们的复苏。”艾莉丝惊醒后，发现自己的竖琴上浮现出全新的符文，这些符文与世界树根系的纹路隐隐呼应。
与此同时，凯洛斯在执行巡逻任务时，遭遇了一群伪装成陨石的维度生物。它们的攻击方式与三年前的黏液怪物截然不同，能够释放出干扰光暗能量的声波。凯洛斯的战甲在声波冲击下濒临崩溃，千钧一发之际，维蕾娜的身影划破星空而来。她尚未完全恢复的三色能量，与维度生物的声波碰撞，产生了意想不到的效果——能量波动竟形成了一个小型的维度旋涡，将敌人尽数吞噬。“原来...调和之力还能这样用。”维蕾娜若有所思，眼神中重新燃起斗志。
在记忆仲裁者总部，一位年轻的仲裁者突发奇想，将自己的记忆与露娜舱内的能量进行融合。奇迹发生了，露娜的手指微微颤动，永恒之鉴的镜面雾气开始消散。记忆泡泡中的画面逐渐改变，黑袍人的狞笑被守望者们的笑颜取代，枯萎的世界树重新抽出嫩芽。露娜的意识在这些温暖记忆的包围下，终于开始苏醒。
零在培育舱前观察火种的成长，突然发现音律火种剧烈震动，发出刺耳的警报声。量子沙盘上，寂静星域的黑色方舟完成了最后的组装，船头的巨眼缓缓睁开，一道紫色光束射向宇宙深处，唤醒了沉睡的维度裂隙残片。“该让新的守护者登场了。”零的机械音带着期待，她取出三颗火种，通过世界树的根系，将它们传送到艾莉丝、凯洛斯和那位唤醒露娜的年轻仲裁者手中。
当三人握住火种的瞬间，耀眼的光芒冲天而起。艾莉丝的竖琴化作流光融入音律火种，她的身上浮现出带有世界树纹路的音波战甲；凯洛斯的光暗剑与光暗火种共鸣，剑身延伸出能撕裂维度的刃芒；年轻仲裁者的记忆权杖与记忆火种结合，杖头绽放出能净化扭曲记忆的金色莲花。露娜、莱娅和维蕾娜同时感受到了这股新生力量的崛起，她们相视一笑，眼中充满欣慰——新的守望者们，已经做好了迎接挑战的准备。 而在黑色方舟上，黑袍人们发出了兴奋的嘶吼，他们期待着，这场维度战争的真正开始......