新宇宙的星空中，由吴仙神纹光粒构筑的星桥如银河脉络般蔓延，每一道桥梁都闪烁着不同文明的光辉。莱娅的世界树在星桥节点上绽放出翡翠色树冠，根系扎根于虚空中，汲取着各个星系的生命力，树冠间穿梭着不同种族的使者，他们以世界树为媒介，共享科技、艺术与思想。
零在万象中枢建立了全新的监测网络，量子沙盘上跳动着数以万计的文明光点，彼此间通过星桥形成复杂的共生网络。但某天，她的机械眼突然捕捉到异常——在宇宙边缘的一片星云中，有个光点正以诡异的规律闪烁，其频率与曾经的禁忌神纹残留波动如出一辙。“这不可能...”她放大数据，发现光点周围的时空正在发生微观层面的扭曲，“那里有东西在逆向解析星桥法则。”
艾莉丝被星桥传来的奇异音律吸引，她拨动神纹竖琴，试图与异常波动共鸣。琴弦震颤间，一段破碎的旋律传入她的意识，那是吴仙神纹中被封印的“逆熵乐章”，但混杂着刺耳的杂音。她的翡翠火种剧烈跳动，在音律的指引下，她看到了一个被黑暗笼罩的文明：那里的居民身体表面布满黑色纹路，行为机械而统一，他们正用某种未知装置吞噬星桥的能量。
凯洛斯的光暗羽翼感应到危机，自发飞向异常区域。当他靠近时，三色能量突然紊乱，混沌之枪上的吴仙神纹竟开始褪色。他在虚空中遭遇无形的屏障，屏障上浮现出与星渊观测者同源的星辰纹路。“是观测者的余孽？”他挥枪刺向屏障，却发现攻击被转化为对方的力量，“他们在利用星桥的开放性渗透新宇宙！”
埃文的记忆权杖亮起警示光芒，记忆火种中涌现出陌生的片段：在某个被遗忘的维度夹缝里，残存的观测者意识与禁忌神纹的黑暗面融合，他们将失败归咎于文明的“自由意志”，发誓要重塑宇宙为绝对秩序的牢笼。“原来他们从未真正消失...”他将记忆投射到万象中枢，“这些黑影正在各个文明中培育‘秩序傀儡’，准备发动第二次清洗。”
维蕾娜的混沌双剑化作流光，穿梭于星桥之间。她发现多个文明的核心区域出现神秘黑袍人，他们手持刻有禁忌神纹的权杖，正用甜言蜜语蛊惑居民：“自由带来混乱，唯有秩序方能永恒。”当她试图攻击黑袍人时，对方的身体竟化作黑雾消散，只留下一句冷笑：“你们以为建立星桥就能高枕无忧？这不过是新的牢笼。”
暗金色种子核心深处苏醒的意识悄然觉醒，它融合了吴仙的神纹智慧与所有文明的抗争记忆，化作一道无形的力量游走于星桥。它在被渗透的文明中种下反抗的火种，唤醒那些被秩序傀儡控制的居民心中对自由的渴望。但随着暗流的涌动，它也感受到一股强大的威胁——观测者余孽正在聚集禁忌神纹的残片，试图复活更恐怖的存在。
在星桥网络的中心，世界树突然剧烈摇晃，莱娅的音律火种感受到前所未有的危机。她通过世界树的根系，看到了观测者的终极计划：他们要利用星桥的能量，在宇宙核心处撕开一道通往“原初熵能海”的裂缝，让绝对秩序的力量淹没所有文明。“我们必须阻止他们！”她的声音通过星桥传遍新宇宙，“自由或许会带来混乱，但那才是生命最本真的模样！”
艾莉丝等人再次集结，他们的火种在经历星桥纪元的洗礼后，变得更加纯粹而强大。暗金色种子核心的意识化作吴仙的虚影，站在众人身旁：“这次，我们将不再被动防御。”他的神纹光芒照亮星桥，“星桥不仅是连接的纽带，更将成为我们反击的武器。”而在宇宙的黑暗深处，禁忌神纹的残片正在汇聚，一双充满恶意的眼睛凝视着这一切，新一轮的文明存亡之战，即将拉开帷幕......