玛格丽特·帕兰斯基说的消息其实也是她刚刚才得知的。
由于神圣奉献舰队的突然袭击，整个新蒙巴萨地球落入了星盟手中，星盟派出了包括“快速调整“在内的七名工程师前往奇科旺地铁站搜索蒙巴萨城地下的先行者建筑。但是另外六名工程师选择解除快速调整身上的炸弹释放了他。而这六名工程师惨遭杀害，快速调整则成功逃进了蒙巴萨城的数据中心。
丹尼尔·恩迪沙博士目睹了这一事件并且命令城市中控电脑的子程序维吉尔追踪快速调整。星盟随后发现了快速调整的叛变，并且派兵前往数据中心准备杀害快速调整防止他逃往UNSc。
于星盟已经占领了城市，悲怆先知留下来的巡洋舰开始挖掘由跃迁跳跃产生的坑洞附近的区域。A-9小队的成员现在是还留在蒙巴萨城里的为数不多的幸存者。
一开始空降的时候A9小队因为悲怆先知的超空间跃迁引起的Emp，整个A9小队被冲击波打的四处分散，直到他们集合的时候依旧缺少了A9小队的新兵J.d 以及爱德华·巴克的前女友，伊丽莎白·黛尔。经过了一系列战斗，爱德华·巴克和自己的队员抵达了城市东北海防堤附近的奇科旺地铁站。
但他们发现地铁站及其周边区域已经被海水淹没。从隧道中撤离也变得不可能。随后爱德华·巴克看到了远处的星盟运输机，他突然灵机一动，带着自己的小队准备劫持一架魅影号运输机。
他们在一处星盟运输机停靠的平台上对星盟部队发起了突袭，很快就把这架运输机夺了下来同时巴克顺便还夺走了一架妖姬战机。完成了计划之后由巴克驾驶妖姬战机为魅影号进行护航，A9小队装作星盟部队悄悄地离开了战场，就在他们即将离开城市地时候，驾驶着妖姬号的爱德华·巴克看着中控电脑数据中心地建筑物。他忽然意识到了自己的女友伊丽莎白·黛尔在哪了，于是他调转方向朝着电脑数据控制中心飞去。
同一时间中，那个失踪的A9小队新兵Jd从自己的降落舱中醒来，他发现整个城市仿佛变成了一片死域，就在他想办法搜寻同伴信息的时候，一个名叫维吉尔的城市AI给了他帮助，不过这个AI也要求他前往数据中心。
没办法谁让一个AI程序的优先级比他一个新兵高，于是Jd根据维吉尔提供的帮助穿过了半个城区，这期间他打过咕噜人，炸过鬼面兽，然后在一处地下设施中和爱德华·巴克的女朋友伊丽莎白·黛尔汇合，Jd从伊丽莎白那里得知两人的目标是相同的，于是两人穿过慢是兵蜂的地下，最后来到了数据中心。
此时的数据中心里到处都是正在寻找什么的星盟部队，两人费劲九牛二虎之力解决了星盟部队，终于来到了维吉尔的目标地点，打开安全屋后Jd惊讶的发现，他们的目标是一个星盟的工程师。
工程师这种生物其实不算是星盟种族，他们是先行者在第一次启动光环之前创造的，外表为粉红色和紫色。工程师没有真正的身体组织和器官，给他们足够的原料，工程师就可以开工干活。
工程师在光环启动后的大劫难当中幸存下来，后来被星盟的先知发现并加以利用。他们是非战斗单位，责任就是维修战舰及设备。在被人类捕获后稍加引导即可修理人类设备。面对像机器一样的工程师，星盟也并没有给予太高的地位。
而这次行动中，悲怆先知将工程师派到了新蒙巴萨地下的先行者遗迹中，让它们开始调试先行者传送门设备。后来悲怆先知因为损失过大而撤退，这里的指挥被早已投靠真相先知的鬼面兽夺取，为了保护先行者遗迹遗迹保密，他们给工程师安装上了炸弹，让它们成为自杀式攻击的载体。
虽说工程师很少说话，甚至表达感情，但是他们终究是有机生物，他们又自己的思想，就在鬼面兽给七个工程师安装上炸弹准备让它们偷袭UNSc的时候，这七个工程师中的六个联合起来将一个名叫疾风校准的工程师身上的炸弹解除并将它放走。
鬼面兽直到后大发雷霆，亲自处死了这些工程师，并下令抓到那个逃跑的工程师。后者利用通风管道和其他设施离开了地下来到了UNSc 的数据控制中心。最后他们再数据中心的地下深处看到了眼前这个工程师，此时这个工程师已经将城市AI融合进了自己的身体并取名维吉尔，原来这一切都是这个星盟工程师为了得救而搞出来的“侦探游戏。”
不过好在他们也不是没有收获，通过疾风校准的透露，他们终于知道了星盟为什么要在这里大动干戈了。
“事情就是这样，我们通过那个星盟工程师得到了这个消息，而且那个外星生物为了给族人复仇，它愿意帮助我们找到方舟传送门。唯一的要求就是尽可能地干掉多的鬼面兽，所以我答应了。”
会议室内，UNSc的高级将领们听完玛格丽特地讲述，他们开始计算这里面的各种风险以及成功率。
“说一说具体方案吧，玛格丽特。我想你不应该只有这一点东西。”泰伦斯·胡德上将看向玛格丽特。
“我们已经知到了方舟传送的具体位置，只是现在它还在星盟手里，接下来我会需要一直战斗力强悍的队伍进入那个地方，占领它，然后等待那个外星工程师的研究以及启动，在这个过程中我们需要保证那个生物的安全。等到开启传送门后，我需要你的舰队进入那里。”
“你的意思是用大半个舰队来吸引走整个星盟舰队？那不可能。”
“不需要你吸引全部，只要能够离开大半，那些还停留在轨道上的雇佣兵就会自己出手，毕竟他们还要靠这个赚钱。”